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보통 베르누이 방정식은 에너지 보존을 써서 유도한다. 에너지 보존식이 뉴턴의 운동방정식에서 나온 결과이므로 베르누이 방정식 또한 운동방정식에서 직접 유도할 수 있다(steady, incompressible, frictionless flow). 유체 입자가 움직이는 경로인 유선 상의 한 지점을 고려하자. 이 지점에서 가속도 벡터는 유선의 접선 방향과 그 지점에서 곡률 중심을 가리키는 법선 방향 성분으로 분해가 가능하다. 유선은 유선의 길이 (s)를 매개변수로 써서 표현할 수 있으므로 이를 이용하면 가속도의 접선 성분은 

at=d|v|dt=dvdt=dvdsdsdt=dvdsv=12dv2ds

가속도의 법선 성분은 구심가속도이므로 그 지점에서 곡률 반지름이 R이면

an=v2R

유선상의 한 지점을 중심으로 하는 부피가 dV=dsdA인 미소 박스를 생각하자.

이 미소 박스에 작용하는 접선 방향의 알짜힘은 박스 좌우에서 작용하는 압력의 차이가 만드는 힘과 중력의 접선성분의 합으로 주어진다:

Ft=P(s+ds/2)dA+P(sds/2)dAρgsinθdV=(dPds+ρgsinθ)dV

미소 부피 속의 유체 질량이 dm=ρdV이므로 접선 방향의 운동방정식은

dPdsρgsinθ=12ρdv2ds

그런데 유체는 비압축성이고, sinθ=dz/ds이므로 다음과 같이 베르누이 방정식을 얻을 수 있다:

dds(P+12ρv2+ρgz)=0orP+12ρv2+ρgz=const

법선 방향의 운동방정식도 같은 방법으로 유도할 수 있는데, 법선 방향의 압력 변화를 dP/dn이라면

dPdn+ρv2R+ρgdzdn=0

이 방정식을 사용하기 위해서는 유선의 각 위치에서의 곡률 반지름에 대한 정보가 주어야 한다.

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